不可不知的土壤分子生态学研究手段
土壤代谢组 | 不成不知的土壤分子生态学钻研技能花腔
土壤代谢组
土壤是作做界最复纯的生态系统之一，是多介量互相做用的复纯环境，具有历程多样性和各向分同性特征。给取非靶向代谢组学办法对土壤中的小分子代谢谱停行阐明，具有高通质、高灵敏度的特点，同时也可联结土壤微生物组高通质测序等多组学技能花腔，有助于钻研从微生物群落构造和罪能到代谢门路的厘革。
土壤代谢物起源
（1）土壤微生物应付环境中物量如有机量的代谢折成
（2）土壤中的动物根系分泌物
（3）土壤微生物自身的内源性代谢物
（4）外来污染物
土壤代谢组使用规模
土壤代谢组研发真测数据
· 实验流程：
· 审定数目：380+
· 检测结果中代谢物分类归属信息：
图1 真测土壤代谢组检测结果1
图2 真测土壤代谢组检测结果2
（注：差异类型土壤的检测结果不同较大）
· 代谢物真测结果示例：
土壤多组学规范钻研案例
New insights into the responses of soil microorganisms to polycyclic aromatic hydrocarbon stress by combining enzyme actiZZZity and sequencing analysis with metabolomics
EnZZZironmental Pollution IF= 6.792
· 布景：
多环芳烃 (PAHs) 是土壤中普遍存正在的污染物，次要是由化石燃料或其余有机物量的不彻底焚烧牌放孕育发作的，多环芳烃污染会扰乱土壤生态环境，对土壤生物和人类组成重大的致癌、致畸和致渐变风险，从而极大地限制了土壤操做。微生物是评估土壤安康的重要目标。做者通过比较高浓度PAHs污染后的土壤中的微生物的品种和富厚、土壤代谢物的区别，去探索土壤量质和污染物之间的联络。
· 次要实验办法：非靶向代谢组学 & 16S高通质测序
· 次要结论：
(1) 多环芳烃胁迫办理组ST和斗劲组CK土壤中微生物相比，根状杆菌显著富集，而鞘氨醇杆菌、分枝杆菌、马西莱氏菌、芽孢杆菌和假杆菌等显著减少，革兰氏阳性菌比革兰氏阴性菌更容易遭到多环芳烃胁迫。
(2) 多环芳烃胁迫极大地克制了脂量代谢，映响了碳水化折物代谢、氨基酸代谢和次级代谢物分解。
(3) 构建不同微生物和不同代谢物的相关性网络，结果发现，变形菌门和拟杆菌门、嗜热菌门、变形杆菌门等和甾醇、皇烷酮、麦角甾醇、3-羟基丁酸等代谢物暗示出强相关性，提示那些微生物可能是对多环芳烃胁迫的差异反馈的要害驱动因素。
· 本文链接：
hts://ss.sciencedirectss/science/article/abs/pii/S0269749119335237
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