首个棉花纤维起始发育单细胞时空组学图谱发布
科技日报北京1月21日电 (记者李禾)记者21日从中国农业科学院棉花钻研所得知,该所马雄风钻研员团队乐成构建了首个联结单细胞转录组、空间转录组及空间代谢组的棉花纤维起始发育图谱,操做该图谱可识别棉花要害基因的表达形式及其取代谢门路的干系,阐发纤维发育历程中的焦点调控机制,为进一步改良棉花纤维品量、进步纤维产质供给了新思路。相关钻研成绩颁发正在国际出名期刊《作做·通讯》上。
棉花是纺织家产的次要本料。棉花纤维是由种子外面皮外表的单细胞发育而来,正在种子发育的晚期阶段,约有25%的胚珠表皮细胞分化成棉絮纤维,并要教训四个差异的阶段,即起始阶段、伸长和初生壁造成阶段、次生壁删厚阶段、纤维成熟阶段。前两个阶段决议了每个种子孕育发作的纤维数质和长度,将间接映响最末棉花纤维产质;后两个阶段取细胞壁删厚相关,决议了纤维强度和细度,并将间接映响最末的棉花纤维品量。
然而,决议上述发育阶段的调控机制正在很急流平上依然未知。因而,解析决议细胞发育命运以及调控棉纤维起始、延伸的机制,将为进步棉花纤维产质和品量供给新门路。
钻研团队以陆地棉范例系TM-1为钻研资料,绘制了棉花纤维晚期发育的单细胞转录组图谱、空间转录组图谱以及空间代谢组图谱,构建了一个多层次的棉花纤维起始发育的动态调控网络,不只能以高甄别率捕捉纤维细胞发育历程中的基因表达形式,还能提醉取基因表达密切相关的代谢厘革,填补了目前正在纤维细胞发育钻研中的技术空皂。
据引见,团队通过进一步多组学结折阐明,审定到一批调控棉花纤维起始发育的要害基因,并选择了此中的一些基因停行罪能验证,发现BEE3基因正在调控纤维起始发育历程中阐扬要害做用,该基因的超表达可以显著促进胚珠表皮细胞发育为纤维细胞。
目前,团队正正在高衣分资料中棉113中,对该基因的罪能机制停行遗传解析,挖掘劣良等位变异,以期为高衣分棉花种类培养开发有价值的分子符号。而棉花纤维起始发育历程中的单细胞组学数据、空间转录组数据等都已停行了共享。